Personnel de l'université

Guillaume COGNE

Enseignant-chercheur (MCU)

Coordonnées

Bât. CRTT, 37 bd de l'Université BP 406 44602 Saint-Nazaire Cedex – France

Bureau
Site de Gavy, bureau 105,
Tél
0240905063
Bureau 2
Bât. CRTT, Bureau 118
Téléphone 2
0240172611
Télécopie 2
0240172618
Mail
guillaume.cogne@univ-nantes.fr

Discipline(s) enseignée(s)

Energétique, génie des procédés

Thèmes de recherche

  • Étude et modélisation de procédés de culture de micro-organismes photosynthétiques (analyse des phénomènes de transfert de matière et d’énergie lumineuse en réacteurs),

  • Modélisation et analyse de systèmes biologiques complexes (physiologie quantitative / calcul des flux métaboliques, analyse énergétique et modélisation des régulations biologiques, réduction de modèles).

  • Activités / CV

    • Diplômes - Qualifications - Titres :

    Ingénieur en Génie Biologique, CUST (école polytechnique de l'Université Blaise Pascal - Polytech'Clermont-Ferrand) (1999)

    DEA de Nutrition et Sciences des Aliments, Université Blaise Pascal (2000)

    Doctorat de l'Université Blaise Pascal, spécialité Génie Biochimique (2003)


    • Travaux - Ouvrages - Articles - Réalisations :

    G.A. Ifrim, M. Titica, G. Cogne, L. Boillereaux, S. Caraman, J. Legrand (2014). Dynamic pH model for autotrophic growth of microalgae in photobioreactor: a tool for monitoring and control purposes. AIChE Journal, 60(2), 585–599.

    F. Courant, A. Martzolff, G. Rabin, J.-P. Antignac, B. Le Bizec, P. Giraudeau, I. Tea, S. Akoka, A. Couzinet, G. Cogne, D. Grizeau, O. Gonçalves (2013). How metabolomics can contribute to bioprocesses: a proof-of-concept study for biomarkers discovery in the context of nitrogen-starved microalgae grown in photobioreactors. Metabolomics, 9(3), 1286-1300.

    G.A. Ifrim, M. Titica, M. Barbu, L. Boillereaux, G. Cogne, S. Caraman, J. Legrand (2013). Multivariable feedback linearizing control of Chlamydomonas reinhardtii photoautotrophic growth process in a torus photobioreactor. Chemical Engineering Journal, 218, 191-203.

    M. Tardif, A. Atteia, M. Specht, G. Cogne, N. Rolland, S. Brugière, M. Hippler, M. Ferro, C. Bruley, G. Peltier, O. Vallon, L. Cournac (2012). PredAlgo, a new subcellular localization prediction tool dedicated to green algae. Molecular Biology and Evolution, 29(12), 3625-3639.

    A. Martzolff, E. Cahoreau, G. Cogne, L. Peyriga, J.-C. Portais, E. Dechandol, F. Le Grand, S. Massou, O. Gonçalves, J. Pruvost, J. Legrand (2012). Photobioreactor design for isotopic non-stationary ¹³C-metabolic flux analysis (INST ¹³C-MFA) under photoautotrophic conditions. Biotechnology and Bioengineering, 109(12), 3030-3040.

    M. Rügen, A. Bockmayr, J. Legrand, G. Cogne (2012). Network reduction in metabolic pathway analysis: elucidation of the key pathways involved in the photoautotrophic growth of the green alga Chlamydomonas renhardtii. Metabolic Engineering, 14, 458-467.

    G. Cogne, M. Rügen, A. Bockmayr, M. Titica, C.-G. Dussap, J.-F. Cornet, J. Legrand (2011). A model-based method for investigating bioenergetic processes in autotrophically growing eukaryotic microalgae: application to the green alga Chlamydomonas reinhardtii. Biotechnology Progress, 27(3), 631-640.

    B. Degrenne, J. Pruvost, G. Christophe, J.-F. Cornet, G. Cogne, J. Legrand (2010). Investigation of the combined effects of acetate and photobioreactor illuminated fraction in the induction of anoxia for hydrogen production by Chlamydomonas reinhardtii. International Journal of Hydrogen Energy, 35(19), 10741-10749.

    J. Pruvost, G. Van Vooren, G. Cogne, J. Legrand (2009). Investigation of biomass and lipids production with Neochloris oleoabundans in photobioreactor. Bioresource Technology, 100(23), 5988-5995.

    G. Cogne, J.-F. Cornet, J.-B. Gros (2005). Design, operation and modeling of a membrane photobioreactor to study the growth of the cyanobacterium Arthrospira platensis in space conditions. Biotechnology Progress, 21(3), 741-750.

    G. Cogne, J.-B. Gros, C.-G. Dussap (2003). Identification of a metabolic network structure of Arthrospira (Spirulina) platensis metabolism. Biotechnology and Bioengineering, 84(6), 667-676.

    G. Cogne, B. Lehmann, C.-G. Dussap, J.-B. Gros (2003). Uptake of macrominerals and trace elements by the cyanobacterium Spirulina platensis (Arthrospira platensis PCC 8005) under photoautotrophic conditions: culture medium optimisation. Biotechnology and Bioengineering, 81(5), 588-593.

    G. Cogne, Ch. Lasseur, J.-F. Cornet, C.-G. Dussap, J.-B. Gros (2001). Growth monitoring of a photosynthetic micro-organism (Spirulina platensis) by pressure measurement. Biotechnology Letters, 23(16), 1309-1314.

    Corps

    Maître de conférences

    Informations complémentaires

    • Participation à des programmes de recherche :

    Projet européen ITN Marie Curie « AccliPhot : Environmental acclimation of photosynthesis » (30 %, coordinateur : Oliver Ebenhöh) (2012-2016).

    Programme ANR BIO-E 10 « ALGO-H2 : Optimisations génétiques, métaboliques et procédé de la photoproduction d'hydrogène par la microalgue verte Chlamydomonas reinhardtii » (20 %, coordinateur : Guillaume Cogne) (2010-2014).

    Programme PIE-CNRS « LipAlg : Profils lipidiques chez les microalgues en fonction des espèces et des conditions de culture » (coordinateur : Jérémy Pruvost) (2009-2012).

    Projet européen (7e PCRD) « SOLARH2 : European solar-fuel initiative - renewable hydrogen from sun and water; science linking molecular biomimetics and genetics » (50 %, coordinateur : Stenbjörn Styring) (2008-2012).

    Programme ANR BIO-E 08 « ALGOMICS : Études globales de la conversion et du stockage de l'énergie chez les microalgues » (30 %, coordinateur : Gilles Peltier) (2008-2012).

    Membre du GdR « Ingénierie des biosystèmes : de la cellule au procédé » (GdR CNRS 3071) (depuis 2008).

    Programme ANR PNRB « BIOSOLIS : Production solaire de micro-organismes photosynthétiques à vocation bioénergétique » (5 %, coordinateur : Jérémy Pruvost) (2007-2010).

    Programme ANR PNRB « SHAMASH : Production de biocarburants lipidiques par des microalgues » (10 %, coordinateur : Olivier Bernard) (2006-2009).

    Membre du GdR « Voies biologiques et biomimétiques de synthèse et d'utilisation de l'hydrogène » (BioH2) (depuis 2006).

    Programme ANR Blanc « PHOTOBIOH2 : Production d'hydrogène à partir d'énergies renouvelables par voie photosynthétique et biomimétique » (40 %, coordinateur : Jack Legrand) (2005-2008).


    • Encadrement doctoral et scientifique :

    Gérard Van Vooren, « Influence des conditions de culture sur les profils lipidiques de micro-algues et exploitation énergétique », depuis octobre 2007 (10 %, directeur : Jérémy Pruvost, co-directeur : Jack Legrand).

    Arnaud Martzolff, « Analyse systémique du métabolisme carboné et énergétique de Chlamydomonas reinhardtii », 2009-2013 (70 %, directeur : Jack Legrand).

    Marco Rügen, « Mathematical analysis of Chlamydomonas reinhardtii metabolic network », 2009-2010 (50 %, co-encadrement : Alexander Bockmayr), Thèse de Master de l'Université libre de Berlin (Freie Universität Berlin).

    Camille Lemasson, « Étude, optimisation et modélisation de la production autotrophe d'hydrogène par Chlamydomonas reinhardtii en photobioréacteur », depuis octobre 2011 (30 %, directeur : Jérémy Pruvost).

    Clément Dousset, « Étude et optimisation de la production de lipides par des micro-algues en photobioréacteur en réponse à une double limitation substrat azoté - lumière », depuis octobre 2012 (30 %, directeur : Jérémy Pruvost).