• IHU prometteur CESTI (Centre Européen des Sciences de la Transplantation et de l'Immunologie), portage Université et CHU de Nantes, Atlanpole ...
  - laboratoires UN impliqués : Centre de Transplantation, Centre de Cancérologie (CRCNA), Laboratoire de Thérapie génique, Laboratoire de Physiopathologie de la résorption osseuse (LPRO), Unité de Recherche de l'Institut du Thorax, Laboratoire d'ingenierie ostéo-articulaire et dentaire (LIOAD)....
• Labex IGO (immunologie), portage L'UNAM, Université de Nantes, Inserm
  - laboratoires UN impliqués : Centre de Cancérologie (CRCNA), Centre de Transplantation, Laboratoire Vaccin anticancer et immunorégulation...)
• Labex IRON (radiopharmaceutiques innovants en oncologie et neurologie), portage L'UNAM, Université de Nantes, Inserm, Arronax
  - laboratoires UN impliqués : Laboratoire de Physique subatomique (Subatech), Centre de Cancérologie (CRCNA), Laboratoire Chimie et Interdisciplinarité (CEISAM)
• Labex TRANSPLANTEX (greffes d'organes), portage Université de Strasbourg
  - laboratoire Université de Nantes impliqués : Centre de Transplantation
• Equipex ARRONAX+ (physique nucléaire, santé), portage GIP ARRONAX, Université de Nantes, CHU de Nantes, ICO, Oniris
  - laboratoires Université de Nantes impliqués : Laboratoire de Physique subatomique (Subatech), Centre de Cancérologie (CRCNA), Laboratoire Chimie et Interdisciplinarité (CEISAM)
• Infrastructure nationale en biologie-santé (INBS) : TEFOR (immunologie, infectiologie, neurologie), portage CNRS ;  F-CRIN et BIOBANQUES, portage Inserm
  - laboratoire UN impliqué : pour TEFOR le Centre de Transplantation, ceux impliqués dans la recherche translationnelle avec le CHU de Nantes
• Démonstrateur pré-industiel en biotechnologies PGT, portage Généthon Ivry, Inserm
  - membre UN impliqué : Philippe MOULLIER directeur de l'UMR Thérapie génique, porteur du projet de démonstrateur
• Infrastructure en Biotechnologies et Bioressources IDEALG (biodiversité marine), portage UEB / UBO
  - laboratoire UN impliqué : Unité de Fonctionnalité  et Ingénierie des Protéines (UFIP)

- Cohortes OFSEP (portage Université Lyon 1), CRYOSTEM (portage Société Française de Greffe de Moelle et Thérapie Cellulaire), RADICO (portage Université Paris 6), CANTO (portage Institut Gustave Roussy, Inserm)

• Biologie Santé (UNantes, UAngers, Oniris)
  

• Fondation (CTRS/RTRS en transplantation) « CENTAURE » (U. de Nantes, U. de Lyon, U. Paris 4 + CHU de Nantes, CHU Lyon, CHU Paris + Inserm + autres partenaires)  
• GIP cyclotron Arronax (multi partenaires dont Région des Pays de Loire et UNantes)
• Cancéropole Grand Ouest (GIP inter-régional Bretagne, Pays de Loire, Poitou-Charentes, Centre, multi partenaires dont l'UNantes)
• Biogenouest  (GIP multi partenaires Bretagne-Pays de Loire dont l'UNantes)
• Centre de Recherche en Nutrition Humaine « CRNH » (GIP multipartenaires : UNantes et UAngers, Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes, CHU de Nantes et Angers, Centres Inra et Ifremer de Nantes)
• GIS Peau (en cours de montage)
• Pôle de compétitivité Atlanpole Biothérapies
• Pole Agro-alimentaire et de Nutrition Nantais « Ponan » (GIS Université, Oniris, Centre Inra de Nantes-Angers)
• Pôle de compétitivité Végépolys
• Institut Fédératif des addictions Comportementales